Qiagen ergänzt Portfolio mit Biobase-Datensammlungen

Wissensdatenbank für klinische Forschung und Diagnostik gestärkt

Peer M. Schatz

Qiagen N.V. gab eine Erweiterung seines branchenführenden Portfolios an Bioinformatik-Lösungen um Datensammlungen von Biobase, einem Anbieter von durch Experten kuratierten biologischen Datenbanken, Software und Dienstleistungen, bekannt. Qiagen erhält damit Zugriff auf die Human Gene Mutation Database (HGMD), eine speziell in klinischen Märkten weitverbreite Ressource mit biomedizinischen Daten, sowie auf weitere einzigartige Inhalte von Biobase.

Damit stärkt das Unternehmen seine weltweit umfassendste, qualitativ hochwertigste und aktuellste Wissensdatenbank für die klinische Forschung und Diagnostik und baut seine marktführende Position in der Analyse und Auswertung von Sequenzierdaten weiter aus. Die Integration von Biobase wird auch zur Stärkung von Qiagens wachsendem Bioinformatik- und Next-Generation-Sequencing-Geschäft sowie zum Ausbau der Beziehungen mit Tausenden von klinischen Labors und NGS-Nutzern in der Life Science Forschung beitragen.

Neue Möglichkeiten für klinische Forschung und Medizin
„Die Möglichkeit, mithilfe von Next-Generation Sequencing (NGS) schnell genomische Erkenntnisse zu generieren, eröffnet neue Möglichkeiten für die klinische Forschung und Medizin. Qiagen adressiert strategisch das Bedürfnis unserer Kunden, die enormen Mengen an Sequenzierdaten auch interpretieren zu können. Mit HGMD und weiteren Inhalten von Biobase, einem renommierten Unternehmen mit einem engagierten Team, sowie einem soliden Portfolio einzigartiger Datenbanken und Software, baut Qiagen seine Position als Gesamtmarktführer im Bereich der klinischen Auswertung von humanen Sequenzierdaten weiter aus“, erläutert Peer M. Schatz, Vorstandsvorsitzender von Qiagen.

"Bereits heute verlassen sich über 15.000 Benutzer weltweit auf Qiagens Bioinformatikprodukte zur Interpretation biologischer Daten, mit deren Hilfe bislang über 250.000 Genomsequenzen verarbeitet worden sind. HGMD passt hervorragend zu unserem Angebot und lässt sich gut integrieren. Wir gehen davon aus, dass wir die Verbreitung dieser führenden literaturbasierten Wissensdatenbank, die durch klinische Referenzlabore für die Annotation von Keimbahnmutationen genutzt wird, weiter steigern können. Gleiches gilt auch für die anderen Lösungen von Biobase. Hierzu werden wir die Produkte von Biobase in Interpretationslösungen auf Basis unserer Ingenuity Knowledge Base integrieren. Auf diese Weise schaffen wir einen Mehrwert für Qiagen- und Biobase-Kunden und unterstützen unsere Wachstumstreiber im NGS und in der Bioinformatik.“

Gut strukturierte Auswertungslösungen zur leichten Durchsuchung
Biobase bietet gut strukturierte Auswertungslösungen, die von hoch qualifiziertem Fachpersonal zusammengestellt und so organisiert werden, dass sie leicht zugänglich und einfach zu durchsuchen sind. Wissenschaftler und klinische Labore können so die Zusammenhänge zwischen verschiedenartigen Informationsbausteinen erkennen und dieses Wissen anwenden. Zusätzlich zur weiteren eigenständigen Vermarktung von Biobase-Produkten hat Qiagen bereits damit begonnen, erste Produkte in die immer umfassendere Qiagen Ingenuity Knowledge Base und die Qiagen-Bioinformatiklösungen, die sich darauf stützen, zu integrieren. Hierzu zählen:

  • HGMD – Human Gene Mutation Database: Bietet umfassende Daten zu vererbbaren krankheitsrelevanten Mutationen bei Menschen. HGMD ermöglicht die schnelle Recherche zu einzelnen Mutationen sowie erweiterte Suchanwendungen und findet in der Humangenetik, in der Diagnostik und persönlichen Gentestung breite Anwendung.
  • PGMD – PharmacoGenomic Mutation Database: Ermöglicht die Identifizierung sämtlicher existierenden Genvarianten, die erwiesenermaßen einen Einfluss auf die Wirkung von Medikamenten haben. Die Software verfügt über mehrere Zugriffsmodelle für diese Daten, einschließlich einer intuitiven Versuchsschnittstelle und der Möglichkeit zum Download der Daten für interne Analysesysteme. 

Zugang zu hochwertigen Inhalten und aktuellen Informationen sehr wertvoll
„Die Auswertung von Sequenzierdaten erfordert den Zugang zu hochwertigen, von Experten kuratierten Inhalten, um schnell und zuverlässig auf die aktuellsten Informationen zu Varianten und assoziierten Phänotypen aus diesen Daten zugreifen zu können“, so Madhuri Hegde, Executive Director am Emory Genetics Laboratory, einem führenden US-Universitätslabor für klinische Genetik. „Die Integration der Biobase-Inhalte wie HGMD und PGMD in das wachsende Informatikportfolio von Qiagen und die Nutzung dieser Inhalte mit branchenführenden Tools wie Ingenuity Variant Analysis und Ingenuity Clinical wird sich für klinische Labore, die sequenzbasierte Diagnosetests durchführen, als außerordentlich wertvoll herausstellen.“

Nutzer der Qiagen Ingenuity Variant Analysis Software profitieren ab sofort vom Zugang zu der HGMD. Die zügige Integration übriger Biobase-Lösungen in die Qiagen Ingenuity Knowledge Base wird Qiagens in Kürze erhältliche klinische NGS-Entscheidungsfindungslösung Ingenuity Clinical unterstützen. Ingenuity Clinical ist eine neue webbasierte Lösung, die eine schnellere, leichtere und hochpräzise klinische Interpretation und Berichterstattung von Informationen aus NGS-basierten Tests bietet. Aktuell nehmen mehr als 20 klinische Testlabors am Early Access Program von Ingenuity Clinical teil, das speziell für die Herausforderungen bezüglich Skalierbarkeit, Geschwindigkeit und Entscheidungsfindung entwickelt wurde, denen sich medizinische Labore bei der Einführung von NGS stellen müssen. Gleichzeitig sind weiterhin kostenlose akademische Versionen von HGMD und PGMD sowie andere führende Produkte wie Proteome und Transfac verfügbar.

Biobase mit Sitz in Wolfenbüttel und Niederlassungen in den USA, Indien und Japan wurde 1997 gegründet. Über 600 Kunden weltweit, einschließlich pharmazeutischer Unternehmen, akademischer Einrichtungen und Forschungsinstituten, nutzen Biobase-Produkte. Michael Tysiak, Vorstandsvorsitzender von Biobase, wird Qiagen als Geschäftsführer von Qiagen Wolfenbüttel – so der Name des neuen Unternehmens – beitreten. Finanzielle Details der Vereinbarung wurden nicht veröffentlicht.